果糖是台式奶茶原料主调味料，分结晶果糖和果葡糖浆，这是形态和成分上的区别，从提取物上也可分为玉米果糖、大米果糖、麦芽果糖、水果果糖、合成果糖等，常用的商业果糖多是玉米果糖和合成果糖，而并非很多人认为的果糖就是水果提取物。不同的提取物提取出的果糖其特征有所区别(如稠度、颜色等)，同时成品果糖其糖度也不尽相同，作为奶茶原料的果糖一般糖度在70%-80%之间(注意:糖度不等同于甜度，两者是不同的概念，也并非越高就越好)。
珍珠奶茶中的珍珠主要成份是“木薯粉”，木薯粉是一种热带植物的块根中提取的淀粉，这种植物属大槭科，与蓖麻，橡胶，小桐子同科。它在加水遇热煮熟后会呈透明状，口感带有弹性。因些在台湾也称之为“波霸珍珠”。
木薯粉是用树薯粉做成的小圆球，而树薯粉则是从树薯或木薯植物(Manihot esculenta)的根部精炼所得的淀粉。它是婴儿食品牛奶布丁的主要成分，也用来使汤汁及炖菜变稠。煮熟后灰色变成黑色，大家也称它为“黑珍珠粉圆“。